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知足者常乐
Updated time: 02/01 2025.
DFT
0. Outline
To summary some useful text on Wechat, Zhihu, Github, or any other source about DFT
- DFT
- Theory
- code-DFT
- Special features
- structure relax
- heterostructure
- …
- Tips
- universal
- Theory
1. Theory
1.1 code-DFT
1.2 Energy band theory
1.3 DFT
-
“根号下的牛顿动力学矩阵” 通过借鉴量子力学中的狄拉克方程,采用平方根操作对经典牛顿动力学矩阵进行了修改,揭示了经典力学和量子力学之间的深刻联系。通过这种变换,牛顿系统的能谱结构类似于量子力学中的薛定谔方程,展现出成对出现的频率,并允许出现零频率的拓扑力学软模,这些软模既反映了力学平衡态中的自由变形模式,也包含自应力模式,从而为理解拓扑力学模态提供了新的视角和数学工具。而动力学矩阵是正定的,零空间只包含力学软模。
1.4 Solid state physics /能带理论
-
描述了三种能带的画法,对一维晶格模型,从波动的角度描述了在布里渊区边界由于散射波引起的能级劈裂。帮助理解了如何从分子轨道到固体物理中的能带。
(20 封私信 / 3 条消息) 轨道杂化和能带的关系? - 知乎
从轨道到能带
1.5 ARPES
1.6 杂化
1.7 Space group
1.8 Surface science
1.9 Tight Binding
1.10 分子轨道理论
1.11 他人资源
- 机器学习势 接口VASP-LAMMPS (qq.com) (包含计算物理课程)
1.12 Phase diagram
1.13 超导
1.14 泛函选择
2. Special features
2.1 underestimating the band gap
- VASP实战-DFT低估带隙的解决方案对比 (qq.com)
- 基于密度泛函的能带计算往往会因为电子的分数占据(这里太复杂,简单讲就是电子不可能即在这里又在那里,但密度泛函关心的是电荷密度,再加上交换关联项都是近似的,所以电子会出现分数占据的问题),而导致低估能带的问题,严重的甚至有可能将半导体误判成导体.
2.2 Convergence
2.3 Elastic constant/单轴拉伸
- https://blog.csdn.net/qq_43658051/article/details/127229547?utm_source=miniapp_weixin
- 微信公众平台 (qq.com)
- 二维材料里的力学性质问题(弹性常数、杨氏模量) (qq.com)
- VASP应力应变计算案例附计算后处理shell脚本
- Linux shell程序调用VASP自动计算应力应变案例
2.4 相变
2.5 lattice constant relaxing
2.6 Fix specified basic vector and relax others’
2.7 Compile / Recompile VASP
2.8 Parameters
- DFT新手教程:VASP中ISIF取值设置 (qq.com)
- VASP并行参数设置和确定KPAR、NCORE的值 (qq.com)
- VASP的关键词详解 (qq.com)
- 《VASP实用教程》:如何根据不同的计算体系选择合适的K点? (qq.com)
- VASP四大输入文件-KPOINTS (qq.com)
2.9 K-points test
2.10 Deformation potential (stretch)
2.11 Encut test
2.12 Exfoliation energy and binding energy
2.13 半导体载流子有效质量
2.14 unfold energy band
2.15 Slab / Surface
- VASP表面计算步骤 (qq.com)
- 利用VASP进行表面计算要怎么做呢
- 科学网—表面界面建模要点/经验小结 Summary about surface/interface modeling - 张召富的博文 (sciencenet.cn)
- 科学网-转载VASP表面计算步骤-孙祥的博文 (sciencenet.cn)
- 大师兄表面能计算
2.16 NEB 过渡态/固体相变
- https://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/neb.html
- https://www.vasp.at/wiki/index.php/Nudged_elastic_bands
- https://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/
- https://www.vasp.at/wiki/index.php/Collective_jumps_of_a_Pt_adatom_on_fcc-Pt_(001):_Nudged_Elastic_Band_Calculation
- https://theory.cm.utexas.edu/henkelman/
- https://uspex-team.org/online_utilities/uspex_manual_release/ChineseVersion/uspex_manual_chinese_V10.5/vcneb.html
2.17 COOP/COHP/Bader电荷
3. OUTPUT
3.1 Energy change
3.2 Force change
3.3 Convergence
3.4 OVITO
3.4.1 多线程
4. Universal
4.1 units transform
4.2 Generate Kpoints, 高对称点
4.3 Other people’s experience
4.4 python
4.5 Parallel computing
- vasp并行参数设置 - 知乎 (zhihu.com)
- vasp中影响并行效率的三个变量KPAR,NPAR,NCORE - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (keinsci.com)
- 如何加快Vasp计算速度(一个实例) - 知乎 (zhihu.com)
- 2016年12月- The Delocalized Physicist —- December 2016 – The Delocalized Physicist (dannyvanpoucke.be)
- VASP加速计算方案总结 - 知乎 (zhihu.com)
4.6 绘制 DOS, BAND
4.7 声子谱/phonopy/自由能校正
4.8 总结
5. Introduction
- 二维TMDs的电子结构和能带调控 (qq.com)
- 第二百五十二期 金属/聚合物界面性能研究 (qq.com)
- 高温合金中各种元素作用——晶界强化元素 (qq.com)
- 高分子玻璃化熵理论 (qq.com)
- 跨越二维材料的极限:MXenes展现无限可能 (qq.com)
- Adv Mater综述:MAX, MXene, MX材料的对比 (qq.com)
- 微信公众平台 (qq.com)
- 磁单极的三世三生——本科生硕士生博士生层面的磁单极精讲 (qq.com)
- 微信公众平台 (qq.com)
- 超权威VASP官方Workshop:维也纳大学开发组Dr. Martijn Marsman亲授)
- 自旋轨道耦合视角下的二维狄拉克材料 (qq.com)
- 密度泛函理论(DFT)在能带计算和半导体材料设计中的应用 (qq.com)
6. Deep-learning neural network
MD
1. Model
晶体物理
1. Theory
1.1 金属位错
1.2 强度理论
1.3 晶体学
1.4 强度和韧性
1.5 薄膜生长理论
2. 实验
2.1 TEM
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